復旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院、遺傳工程國家重點(diǎn)實(shí)驗室甘建華課題組與李繼喜課題組合作研究揭示了非洲豬瘟病毒(ASFV)DNA連接酶(AsfvDNAL)的分子機制。該項成果近日在線(xiàn)發(fā)表于《自然—通訊》。
ASFV是一種獨特的雙鏈DNA病毒,能導致受感染豬死亡,受到了科研人員的廣泛關(guān)注,盡管已研究了100多年,目前仍沒(méi)有任何有效的疫苗被報道。ASFV對全球多個(gè)國家和地區的豬飼養業(yè)都是一種巨大的威脅,并于2018年在中國首度暴發(fā),導致了嚴重的經(jīng)濟損失。
ASFV是一種獨特的雙鏈DNA病毒,能導致受感染豬死亡,受到了科研人員的廣泛關(guān)注,盡管已研究了100多年,目前仍沒(méi)有任何有效的疫苗被報道。
ASFV中有一套完整的DNA修復通路。與通常的DNA修復通路不同,ASFV的DNA修復通路中的聚合酶和連接酶的保真性都非常低,在A(yíng)SFV基因組的修復和突變過(guò)程中均發(fā)揮了關(guān)鍵作用。
據悉,該團隊此前研究發(fā)現,AsfvPolX擁有一個(gè)獨特的磷酸根識別位點(diǎn),對其底物結合和催化活性十分關(guān)鍵?!癆sfvDNAL與同源蛋白的序列相似性很低,但其容忍堿基錯配的分子機制還不明確?!痹撜撐囊蛔髡哧愐賱透嬖V《中國科學(xué)報》,研究人員利用X射線(xiàn)晶體學(xué)方法,成功解析了AsfvDNAL與不同類(lèi)型DNA復合物的高分辨率結構。
晶體結構顯示,AsfvDNAL具有一個(gè)獨特的DNA結合結構域,該結構域對底物結合十分重要。雖然AsfvDNAL與常見(jiàn)的DNA連接酶在催化機制方面保守,但AsfvDNAL在底物催化位點(diǎn)附近具有一些明顯不同的氨基酸組成。
“蛋白突變、體外DNA結合以及活性研究顯示,催化位點(diǎn)附近的氨基酸對催化形式AsfvDNAL-DNA復合物的形成及活性至關(guān)重要?!备式ㄈA表示,這項研究成果為針對非洲豬瘟病毒DNA修復通路蛋白的藥物設計提供了結構基礎。
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